Ο π. Νεκτάριος διακόνησε για πολλά έτη ως οικονόμος του Ιερού Κουτλουμουσιανού Μετοχίου Αγίας Σκέπης στη Νέα Πέραμο.
Ο μακαριστός Ιερομόναχος υπήρξε από τα πρώτα μέλη της αδελφότητας που επάνδρωσαν την αγιορείτικη Ιερά Μονή Κουτλουμουσίου, υπό την καθοδήγηση του πρώην καθηγουμένου Αρχιμανδρίτη Χριστόδουλου.