Ο Όσιος Μάρκελλος καταγόταν από την Απαμεία της Συρίας από ένδοξο και περιφανές γένος. Ανάλωσε την κληρονομιά του στις σπουδές και την μόρφωσή του, χάρη στα οποία έγινε διάσημος. Προκειμένου να επισκεφτεί πνευματικά κέντρα της εποχής από την Συρία μετέβη στην Έφεσο, ενώ αργότερα εκάρη μοναχός σε κάποια μονή της Εφέσου, ασκούμενος με αυστηρότητα. Όταν άκουσε τα περί υψηλής αρετής και φρονήματος του Ηγουμένου της Μονής των Ακοιμήτων Αλεξάνδρου, κατέφυγε σε αυτόν. Τόσο ασκήθηκε αυστηρά και πρόκοψε εν Χριστώ που μετά την κοίμηση του Αλεξάνδρου, οι μοναχοί τον κάλεσαν να αναλάβει την Ηγουμενία της Μονής. Όταν εκείνος αρνήθηκε, εξέλεξαν τον Ιωάννη (ή κατ’ άλλους τον Ιάκωβο). Μόνο μετά την κοίμηση και του νεοεκλεγέντα Ηγουμένου, συγκατάνευσε να αναλάβει την Ηγουμενία (460-465). Κατά τη διάρκειά της προήγαγε και μεγάλωσε τη μονή, χάρη στην προσφυγή σε αυτήν του ευπατρίδη και πλουσιωτάτου Φαρετρίου.